El primer núcleo de los Museos Vaticanos fue la colección de estatuas que empezaron a exhibirse bajo la dirección de Julio II en el llamado “Patio de las Estatuas”, actualmente “Patio Octágono”. Los Museos y Galerías Pontificias, en un primer momento conocidas como Museo Pío- Clementino – deben la disposición de las salas en locales accesibles al público a Clemente XVI y Pío IV – . Posteriormente fueron ampliadas de manera notable, al serles añadidas las salas del Museo Chiaramonti, del Brazo Nuovo y de la Galería Lapidaria. Antes del Tratado de Letrán los Museos y Galerías Pontificias dependían de la Prefectura de los SS. PP. AA.; desde 1929 dependen del Governatorato del Estado de la Ciudad del Vaticano. Su amplia estructura museística incluye colecciones de Arte Antiguo – el Museo Etrusco ( 1837), el Museo Egipcio (1839), el Museo Profano Lateranense (1844), el Museo Gregoriano Profano y el Museo Pío Cristiano (1970)- y colecciones de Arte moderno como la Galería de los Tapices, Galería de las Cartas Geográficas, las Estancias y la Loggia de Rafael, la Capilla del Beato Angélico, la Capilla Sixtina, el Apartamento Borgia y la Pinacoteca Vaticana, entre otros.