El museo se crea para acoger el rico patrimonio arqueológico de Alicante, pero no quiere quedarse en una mera exposición de piezas debidamente restauradas si no que presenta una vocación de museo abierto, didáctico y entretenido. Con su diseño vanguardista y en sus 9000 m2, muestra los testimonios de nuestro pasado invitándonos a realizar un apasionante viaje en el tiempo. Las salas permanentes se articulan en los siguientes espacios: Prehistoria, Íberos, Cultura romana y Edad Media. El museo cuenta con otras salas polivalentes que sirven de espacio de acogida para exposiciones temporales.

El 8 de mayo de 2004 el MARQ fue galardonado con el EMYA Premio Europeo al Mejor Museo, creado en 1977 por la European Museum Forum con respaldo del Consejo de Europa, que tiene como objetivo el reconocimiento de aquellos museos comprometidos con la renovación de los lenguajes expositivos y con la promoción de un turismo cultural en Europa.