Inaugurado en 1839 en el antiguo convento de Santa Cruz, los fondos iniciales son los bienes incautados durante la desamortización de Mendizábal. Tras pasar por varias ubicaciones, las colecciones se instalan de manera definitiva en 1957, teniendo como sede el palacio de Carlos V. En sus salas pueden contemplarse pinturas, esculturas, esmaltes y vidrieras fechables entre los siglos XV al XX, entre los que se encuetran obras de artistas como: Jacobo Florentino, Hnos. Penicaud, Diego de Siloé, Fray Juan Sánchez Cotán, Pedro de Mena, Alonso Cano, Pedro de Moya, P. Atanasio Bocanegra, Juan de Sevilla, José Risueño, José Mª Rodriguez-Acosta, José Mª López Mezquita y Gabriel Morcillo, entre otros. También posee un conjunto interesante de pintura de artistas granadinos de los siglos XIX y XX. Dentro del programa museístico se incluyen diversas actividades educativas.

En el ala Sur de la planta baja del Palacio de Carlos V está también emplazado el Museo de la Alhambra, dedicado al arte y la cultura hispanomusulmana.