El edificio, un volumen de planta circular proyectado por el arquitecto José Antonio Galea, se construye en 1990 sobre el solar de la antigua cárcel de Badajoz. Con este museo, la capital extremeña recupera su papel de lugar de encuentro entre España y Portugal, al tiempo que reanuda los lazos que por razones históricas han unido a Extremadura con Latinoamérica.
Los fondos del MEIAC están agrupados en cuatro grandes colecciones. Dentro de la colección de obras españolas se cuentan nombres tan significativos como los de: P. Irazu, J. M. Sicilia, J. Uslé. Eva Lootz, J. N. Baldeweg o Susana Solano. Entre los artistas representados en la colección latinoamericana encontramos a Juan Dávila, Gabriel Orozco, José Bedia o Andrés Serrano y en la colección portuguesa a Helena Almeida, Julião Sarmento o Pedro Cabrita Reis. Finalmente, la Colección Extremadura posee obras de Juan Barjola, Equipo 57, Godofredo Muñoz o Florentino Díaz. Además de exposiciones temporales, el MEIAC ha organizado diversos foros de intercambio y diálogo con Latinoamérica, así como varios ciclos de música y videocreación. Dentro de sus proyectos está el de crear una galería virtual de arte digital.