Eugène Delacroix vivió en la actual sede del museo que lleva su nombre entre 1857 y 1863, año de su muerte. Desde entonces, varios inquilinos ocuparon este espacio hasta que, por razones inmobiliarias, se propuso su destrucción. Fue entonces cuando los artistas Maurice Denis y Paul Signac; dos historiadores especializados en Delacroix, André Raymond y Joubin Escholier, y el Doctor Viau crearon la Sociedad de Amigos de Eugène Delacroix para salvar el que fue su taller.

Esa Sociedad organizó exposiciones, conciertos y conferencias en torno al artista a partir de 1932 y logró financiación para adquirir el apartamento, el estudio y el jardín privado de Delacroix, que serían cedidos al Estado francés en 1954.

En 1971 se constituyó como tal el Musée National Eugène Delacroix, hoy asociado al Louvre.